Facebook, bu adımıyla bir süredir eleştirilen zayıf güvenlik önlemlerini artırmaya çalışsa da bu önlem WhatsApp’ta olduğu gibi, Messenger’da etkin değil. Bu özelliği kullanmak için kullanıcıların ayarlar menüsünden aramalar için uçtan uca şifrelemeyi etkinleştirmesi gerekiyor. Platform üzerinden yapılan aramalar, özelliğin açılmaması halinde veri sızıntılarına karşı savunmasız kalıyor.